档案以个人名义存放在人才中心与存在公司名下的主要区别在于存档方式、目的、内容以及查阅提取的便利性，但 并不影响退休。具体分析如下：

存档方式

个人存档：将档案材料交由人才服务机构（如人才档案中心）统一管理，方便个人查询和利用，同时保证档案的安全和保密性。

单位存档：由具备人事档案管理权的机构（如企业人事部门）集中统一管理档案，通常以纸质和电子两种形式存档。

存档目的

个人存档：便于将来考研、考公务员、评职称、国企央企入职、退休、积分落户等。

单位存档：主要是为了管理员工的个人信息，方便人员管理和相关事宜的处理。

档案内容

个人存档：包括学历、学位、就业、成绩单、入党情况等。

单位存档：包括员工的学历、学位、职业资格、职务变迁、工资变动等信息。

查阅和提取

个人存档：本人可以自由查阅和提取档案。

单位存档：查阅和提取档案可能需要通过单位人事部门进行。

关于退休，档案的存放方式并不直接影响退休金的计算和发放。退休金的数额主要取决于缴纳的社保费、缴费年限、缴费金额和缴费所在地等因素。因此，无论是个人存档还是单位存档，只要社保缴纳记录完整，就不会对退休产生实质性影响。

建议：

如果是在职员工，建议将档案存放在单位名下，以便于单位管理和办理相关事宜。

如果已经离职或转为自由职业者，可以选择将档案存放在人才中心，以便于个人查询和利用，同时保证档案的安全和保密性。

无论选择哪种存档方式，都需要确保档案材料的完整和准确，以便在需要时能够顺利查阅和利用。